Die Aufgaben der Lebensmittelkontrolle sind vielfältig. Sie erstrecken sich entlang der Lebensmittelkette von der Inspektion der Primärproduktionsbetriebe und der Lebensmittelbetriebe, dem Erheben von Proben über Abklärungen bei Lebensmittelvergiftungen bis hin zu Beschlagnahmungen und Betriebsschliessungen. "From farm to fork - vom Stall auf den Teller" ist das Stichwort.

Auch die Begutachtung von Baugesuchen der Lebensmittelbetriebe gehört zu den Aufgaben, ebenso die Beurteilung der Kennzeichnung von Lebensmitteln und Gebrauchsgegenständen.

Alle Lebensmittel sind tierischen oder pflanzlichen Ursprungs, weshalb der Kontrolle von Landwirtschaftsbetrieben eine grosse Bedeutung zukommt. Eine einwandfreie Erzeugung von Lebensmitteln auf dem bäuerlichen Herkunftsbetrieb ist von grösster Bedeutung, da die landwirtschaftliche Produktion am Anfang der Lebensmittelkette steht. Die Gesetzgebung regelt u.a. den Einsatz von Tierarzneimitteln für Nutztiere und verpflichtet den Produzenten, solche Einsätze zu dokumentieren. Die Milchproduzenten sind verpflichtet, die Kühe sauber und gesund zu halten und die Milch nach vorgegebenen Hygienevorschriften zu produzieren. Die landwirtschaftlichen Produkte dürfen nicht übermässig mit Rückständen von Fremdstoffen wie Pflanzenschutzmitteln, Umweltkontaminanten und Tierarzneimitteln verunreinigt sein.

Die Inspektion von Landwirtschaftsbetrieben (Primärproduktion) umfasst zum Beispiel folgende Bereiche:

• Selbstkontrolle und Aufzeichnungen: Tierarzneimitteleinsatz, Tiergesundheitskontrollen,
• Räumlichkeiten und Einrichtungen: Sauberkeit und Ordnung, baulicher Zustand
• Umgang mit Lebensmitteln: Hygiene, Lagerung, Kühlhaltung
• Tierhaltung und Fütterung: Sauberkeit, Pflege und Gesundheitszustand,

• Selbstkontrollkonzept: Prüfung der Unterlagen für Qualitätssicherung und Selbstkontrolle. Rückverfolgbarkeit.

• Zustand der Lebensmittel: Sinnenprobe (Aussehen, Geruch, Geschmack, Veränderungen, Verunreinigung, Alter, Genusstauglichkeit, Verderb, Gesundheitsrisiko). Eventuelle Probenahme.
• Prozesse und Tätigkeiten: Sauberkeit, Systematik und Ordnung: Werkzeuge, Maschinen, Apparate, Einrichtungen, Räume, Fahrzeuge usw. Umgang mit Lebensmitteln: Lagerung, Kühlhaltung, Lebensmittelhygiene, Betriebshygiene, Personalhygiene
• Baulicher Zustand: Wände, Böden, Decken; Technische Einrichtungen: Grundausrüstung, Zustand und Funktionsfähigkeit
• Prüfung von Anpreisung: Etiketten, Speisekarte, Getränkekarte, Reklamen usw.

Die Kontrollorgane können bei Bedarf auch in Lieferscheine, Rezepturen und Kontrollunterlagen Einblick nehmen.

Neben Betriebsinspektionen basiert die Lebensmittelkontrolle auch auf der Untersuchung von risikobezogenen Stichproben aus der Produktion und beim Verkauf.